L’examen anatomopathologique est pratiqué sur des coupes de biopsies gastriques colorées par coloration de Giemsa modifiée ou par la coloration argentique. Il permet, en plus de la détection de H.pylori, l’étude de l’état de la muqueuse et est indispensable au diagnostic, au typage, au grading et à la stadification des lésions associées à l’infection.
La sensibilité et la spécificité de l’examen histologique sont toujours supérieures à 90% dans les différentes publications scientifiques (96,8 % à100 % de sensibilité ; et 97,7 % de spécificité). (Amir-Tidadini,2003)